Ondokuz Mayıs Üniversitesi Tıp Fakültesi Temel Tıp Bilimleri Bölümü, temel tıp eğitimi vermektedir. Bölüm tarafından mezuniyet öncesi tıp eğitiminde; canlılığın devamı için gerekli özellikler, hastalıklar, hastalık oluşum mekanizmaları ve tedavinin temel prensipleri farklı evre ve yıllarda öğrencilere aktarılmaktadır. Bu doğrultuda çeşitli eğitim faaliyetleri yürütülürken, ilgili bazı anabilim dallarınca da tıpta uzmanlık eğitimi verilmektedir. Ayrıca üniversite bünyesinde öğrenim gören doktora ve yüksek lisans öğrencilerinin akademik faaliyetleri de yine bu birimler tarafından desteklenmektedir.
Ondokuz Mayıs Üniversitesi Tıp Fakültesi Temel Tıp Bilimleri Bölümü bünyesinde yer alan anabilim dalları şunlardır:
Anatomi Anabilim Dalı
Biyofizik Anabilim Dalı
Biyoistatistik ve Tıbbi Bilişim Anabilim Dalı
Fizyoloji Anabilim Dalı
Histoloji ve Embriyoloji Anabilim Dalı
Tıp Eğitimi Anabilim Dalı
Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı
Tıbbi Biyokimya Anabilim Dalı
Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı